Šajā sadaļa ir apkopota HPC klasterī instalētā lietojumprogrammatūra, kas būs pieejama, kļūstot par klastera lietotāju (aizpildot pieteikumu) un pieslēdzoties klastera interfeisam (instrukcija ŠEIT). Ja katalogā neatrodat sev vajadzīgo programmatūru, sazinieties ar mums, un mēs izskatīsim tehniskās iespējas to instalēt. Programmatūru savā lietotāja apgabalā Lietotāji var instalēt (kompilēt) arī paši.

Katalogs

Atvērtā koda

lietojumprogrammatūra

bcl2fastq (ver. 1.8.4)

Blender (ver. 2.7)

GROMACS (ver.2016-1)

Hashcat 

Network Simulator 2 (ver. 2.34)

OpenFoam (ver. 2.4, 5)

Peridigm (ver. 1.5)

R (ver. 3.4.0)

SalomeMeca (ver. 2015)

Scilab  (ver. 5.4)

Komerciālo izstrādātāju

lietotājprogrammatūra

Agisoft PhotoScan

COMSOL Multiphysics (ver. 5.3a)

Matlab (ver. 2017b)

Programmēšanas

valodas/kompilatori/rīki 

Conda/Anaconda (ver. 4.4)

CUDA Toolkit (ver. 8.0)

GCC (ver. 4.8.5)

Intel Parallel Studio (ver. 2015)

Intel MPI (ver. 4.0.3)

OpenMPI (ver. 1.10.5a)

Perl (ver. 5)

Python (ver. 2.7, 3.6)

R (ver. 3.4.0)

Klasterī tiek izmantoti moduļi (Environment Modules). Lai sagatavotu lietotāja darba vidi konkrētas programmatūras izmantošanai:

module load module_name

Iegūt pilnu pieejamo moduļu sarakstu:

module avail

Programmu palaišanas skriptu piemērus klasterim atradīsiet direktorijā:

/opt/exp_soft/user_info

Lai saņemtu individuālu palīdzību skripta izveidē, sazinieties ar HPC centru, rakstot e­pastu uz hpc@rtu.lv  .